Introdução

A pandemia do novo coronavirus tomou o mundo de assalto. Notícias em todo o lugar dão conta do rápido alastramento do vírus em todo o mundo, e os seus números são alarmantes.

Para permitir que mais e mais pessoas possam ajudar no combate ao vírus, das mais diversas formas, organizações ao redor do mundo tem disponibilizado dados sobre a evolução da COVID-19 em todo o globo.

Dentre as organizações que disponibilizam dados estão a European Union Open Data Portal, a John Hopkins University através de um repositório no GitHub.

Com abundância de dados, me propus a realizar algumas explorações e tabulações destes dados visando entender melhor o cenário mundial.

Disclaimer

Este é um trabalho em andamento; não tem cunho científico e nem pretende que sirva de embasamento para qualquer tomada de decisão. É uma abordagem estritamente pessoal.

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Base de dados do EU Open Data Portal

Os dados desta seção vieram do Europe Open Data Portal – https://data.europa.eu/euodp/en/

2020-03-26: Houve uma mudança na nomenclatura dos arquivos; a partir da atualização de 25 de Março de 2020 o arquivo não mais tem o sufixo no formato da data, por exemplo, “…2020-03-24.xlsx”. Assim, algumas partes do código estão sendo mudadas para refletir esta mudança. Não sei se é uma mudança permanente ou alguém esqueceu de colocar o nome correto do arquivo.

A estrutura dos dados é:

## Classes 'tbl_df', 'tbl' and 'data.frame':    7904 obs. of  10 variables:
##  $ dateRep                : POSIXct, format: "2020-03-31" "2020-03-30" ...
##  $ day                    : num  31 30 29 28 27 26 25 24 23 22 ...
##  $ month                  : num  3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 ...
##  $ year                   : num  2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 2020 ...
##  $ cases                  : num  27 8 15 16 0 33 2 6 10 0 ...
##  $ deaths                 : num  0 1 1 1 0 0 0 1 0 0 ...
##  $ countriesAndTerritories: chr  "Afghanistan" "Afghanistan" "Afghanistan" "Afghanistan" ...
##  $ geoId                  : chr  "AF" "AF" "AF" "AF" ...
##  $ countryterritoryCode   : chr  "AFG" "AFG" "AFG" "AFG" ...
##  $ popData2018            : num  37172386 37172386 37172386 37172386 37172386 ...

Total de Casos pelos dados da EU Open Data Portal: 30-03-2020

Casos no Mundo (EU Open Data Portal)
777798

Brasil vs Itália

Uma mostra dos últimos 20 dias da Itália.

DateRep Day Month year Cases Deaths Country geoId countryterritoryCode popData2018 CumCases
2020-03-12 12 3 2020 2313 196 Italy IT ITA 60431283 12462
2020-03-13 13 3 2020 2651 189 Italy IT ITA 60431283 15113
2020-03-14 14 3 2020 2547 252 Italy IT ITA 60431283 17660
2020-03-15 15 3 2020 90 173 Italy IT ITA 60431283 17750
2020-03-16 16 3 2020 6230 370 Italy IT ITA 60431283 23980
2020-03-17 17 3 2020 4000 347 Italy IT ITA 60431283 27980
2020-03-18 18 3 2020 3526 347 Italy IT ITA 60431283 31506
2020-03-19 19 3 2020 4207 473 Italy IT ITA 60431283 35713
2020-03-20 20 3 2020 5322 429 Italy IT ITA 60431283 41035
2020-03-21 21 3 2020 5986 625 Italy IT ITA 60431283 47021
2020-03-22 22 3 2020 6557 795 Italy IT ITA 60431283 53578
2020-03-23 23 3 2020 5560 649 Italy IT ITA 60431283 59138
2020-03-24 24 3 2020 4789 601 Italy IT ITA 60431283 63927
2020-03-25 25 3 2020 5249 743 Italy IT ITA 60431283 69176
2020-03-26 26 3 2020 5210 685 Italy IT ITA 60431283 74386
2020-03-27 27 3 2020 6153 660 Italy IT ITA 60431283 80539
2020-03-28 28 3 2020 5959 971 Italy IT ITA 60431283 86498
2020-03-29 29 3 2020 5974 887 Italy IT ITA 60431283 92472
2020-03-30 30 3 2020 5217 758 Italy IT ITA 60431283 97689
2020-03-31 31 3 2020 4050 810 Italy IT ITA 60431283 101739

O mesmo para o Brasil, últimos 20 dias.

DateRep Day Month year Cases Deaths Country geoId countryterritoryCode popData2018 CumCases
2020-03-12 12 3 2020 18 0 Brazil BR BRA 209469333 52
2020-03-13 13 3 2020 25 0 Brazil BR BRA 209469333 77
2020-03-14 14 3 2020 21 0 Brazil BR BRA 209469333 98
2020-03-15 15 3 2020 23 0 Brazil BR BRA 209469333 121
2020-03-16 16 3 2020 79 0 Brazil BR BRA 209469333 200
2020-03-17 17 3 2020 34 0 Brazil BR BRA 209469333 234
2020-03-18 18 3 2020 57 1 Brazil BR BRA 209469333 291
2020-03-19 19 3 2020 137 3 Brazil BR BRA 209469333 428
2020-03-20 20 3 2020 193 2 Brazil BR BRA 209469333 621
2020-03-21 21 3 2020 283 5 Brazil BR BRA 209469333 904
2020-03-22 22 3 2020 224 7 Brazil BR BRA 209469333 1128
2020-03-23 23 3 2020 418 7 Brazil BR BRA 209469333 1546
2020-03-24 24 3 2020 345 9 Brazil BR BRA 209469333 1891
2020-03-25 25 3 2020 310 12 Brazil BR BRA 209469333 2201
2020-03-26 26 3 2020 232 11 Brazil BR BRA 209469333 2433
2020-03-27 27 3 2020 482 20 Brazil BR BRA 209469333 2915
2020-03-28 28 3 2020 502 15 Brazil BR BRA 209469333 3417
2020-03-29 29 3 2020 487 22 Brazil BR BRA 209469333 3904
2020-03-30 30 3 2020 352 22 Brazil BR BRA 209469333 4256
2020-03-31 31 3 2020 323 23 Brazil BR BRA 209469333 4579

As bases de dados não contém informação do Continente, ou seja, a qual continente pertence cada país. Assim, foi feito um merge com uma base que contém os nomes dos países, continente e a capital de cada país.

Os nomes dos países foram normalizados entre as bases, acertando grafia e outras inconsistências nos nomes. Países cujo continente não pode ser identificado foi marcado.

Alguns gráficos exploratórios com a base EU Open Data Portal

Países com mais de 500 casos confirmados: 30-03-2020

Países (com mais de 500 casos) ordenados por número de casos confirmados
País Casos Mortes
USA 164650 3170
Italy 101739 11591
Spain 85195 7340
China 82241 3309
Germany 61913 583
France 44550 3024
Iran 41495 2757
United Kingdom 22141 1408
Switzerland 15412 295
Belgium 11899 513
Netherlands 11750 864
Turkey 11535 168
South Korea 9786 163
Austria 9618 108
Canada 7424 89
Portugal 6408 140
Brazil 4579 159
Australia 4557 19
Israel 4473 17
Norway 4226 26
Sweden 4028 146
Czech Republic 3002 24
Ireland 2910 54
Malaysia 2626 37
Denmark 2577 77
Chile 2449 8
Philippines 2084 88
Poland 2055 31
Luxembourg 1988 22
Ecuador 1966 62
Japan 1953 56
Romania 1952 44
Russia 1836 10
Thailand 1651 10
Pakistan 1625 18
Saudi Arabia 1453 8
Indonesia 1414 122
South Africa 1326 3
Finland 1313 13
India 1251 32
Greece 1212 43
Mexico 1094 28
Iceland 1086 2
Panama 1075 26
Argentina 966 24
Peru 950 24
Dominican Republic 901 42
Singapore 844 3
Colombia 798 14
Croatia 790 6
Slovenia 763 11
Serbia 741 13
Estonia 715 3
Qatar 693 1
New Zealand 647 1
Iraq 630 46
United Arab Emirates 611 5
Egypt 609 40
Morocco 556 33
Bahrain 515 4
Algeria 511 31

Base de dados da John Hopkins University

O JHU tem um site de monitoramento em tempo real (talvez o mais atualizado) no endereço https://coronavirus.jhu.edu/map.html. Os dados utilizados para o mapa estão em um GitHub https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19. Tem dados com atualização diária (parece que no mapa as atualizações são mais constantes; no final do dia são atualizados no GitHub).

Este é o link onde aparece o mapa também: https://data.humdata.org/dataset/novel-coronavirus-2019-ncov-cases

Fazendo o download dos arquivos diários ao invés destes consolidados (não tem o Recovered na última atualização)

O JHU mantém pelo menos 2 formatos dos dados: diários e consolidados (time series). Eu tentei utilizar o formato time series inicialmente, mas mudei para o formato diário, de modo que eu mesmo faço a consolidação. Isso permitiu um pouco mais de controle sobre os dados baixados.

Os dados são mantidos neste repositório GitHub:

https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/raw/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_daily_reports/

O nome dos arquivos é MM-DD-YYYY.csv, começando a partir de 22 de Janeiro de 2020.

## [1] "Fazendo dowload do arquivo:~/datasets/CSSEGISandData/COVID-19/csse_covid_19_daily_reports/03-30-2020.csv"

Depois de feito o download de todos os arquivos, é preciso juntá-los em um único data.frame. O processo começa com a leitura de todos os csv, colocando-os todos em uma list.

Com a lista de todos os arquivos (data.frames) diários, a função bind_rows do dplyr faz a concatenação. Algumas correções de nomes de países são também realizadas, visando normalizar e acertar grafias.

Total de Casos pelos dados da John Hopkins University (JHU): 30-03-2020

Casos Confirmados Mortos Recuperados
776030 37431 158784

Últimos 10 dias para alguns países: 30-03-2020

França
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
France 2020-03-21 14308 562 12 Europe
France 2020-03-22 16214 676 2201 Europe
France 2020-03-23 20123 862 2207 Europe
France 2020-03-24 22622 1102 3288 Europe
France 2020-03-25 25600 1333 3907 Europe
France 2020-03-26 29551 1698 4955 Europe
France 2020-03-27 33402 1997 5707 Europe
France 2020-03-28 38105 2317 5724 Europe
France 2020-03-29 40708 2611 7226 Europe
France 2020-03-30 45170 3030 7964 Europe
Itália
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Italy 2020-03-21 53578 4825 6072 Europe
Italy 2020-03-22 59138 5476 7024 Europe
Italy 2020-03-23 63927 6077 7432 Europe
Italy 2020-03-24 69176 6820 8326 Europe
Italy 2020-03-25 74386 7503 9362 Europe
Italy 2020-03-26 80589 8215 10361 Europe
Italy 2020-03-27 86498 9134 10950 Europe
Italy 2020-03-28 92472 10023 12384 Europe
Italy 2020-03-29 97689 10779 13030 Europe
Italy 2020-03-30 101739 11591 14620 Europe
Espanha
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Spain 2020-03-21 25374 1375 2125 Europe
Spain 2020-03-22 28603 1756 2125 Europe
Spain 2020-03-23 35136 2311 3355 Europe
Spain 2020-03-24 39885 2808 3794 Europe
Spain 2020-03-25 49515 3647 5367 Europe
Spain 2020-03-26 57786 4365 7015 Europe
Spain 2020-03-27 65719 5138 9357 Europe
Spain 2020-03-28 73235 5982 12285 Europe
Spain 2020-03-29 80110 6803 14709 Europe
Spain 2020-03-30 87956 7716 16780 Europe
Brasil
Country DateRep ConfirmedCases Deaths Recovered Continent
Brazil 2020-03-21 1021 15 2 America
Brazil 2020-03-22 1546 25 2 America
Brazil 2020-03-23 1924 34 2 America
Brazil 2020-03-24 2247 46 2 America
Brazil 2020-03-25 2554 59 2 America
Brazil 2020-03-26 2985 77 6 America
Brazil 2020-03-27 3417 92 6 America
Brazil 2020-03-28 3904 111 6 America
Brazil 2020-03-29 4256 136 6 America
Brazil 2020-03-30 4579 159 120 America

Para poder estudar o crescimento do número de casos e de mortes, foi adicionada uma coluna com o número de casos de um dia para o outro, já que a base de dados reporta o total de casos em cada dia e não quantos casos foram registrados naquele dia.

Lista de países ordenados por número de casos confirmados: 30-03-2020

País Casos Mortes Recuperados
USA 161807 2978 5644
Italy 101739 11591 14620
Spain 87956 7716 16780
China 82198 3308 75923
Germany 66885 645 13500
France 45170 3030 7964
Iran 41495 2757 13911
United Kingdom 22453 1411 171
Switzerland 15922 359 1823
Belgium 11899 513 1527
Netherlands 11817 865 253
Turkey 10827 168 162
Austria 9618 108 636
South Korea 7478 53 118
Canada 7398 80 466
Portugal 6408 140 43
Israel 4695 16 161
Brazil 4579 159 120
Norway 4445 32 12
Australia 4361 17 257
Sweden 4028 146 16
Ireland 2910 54 5
Denmark 2755 77 73
Malaysia 2626 37 479
Chile 2449 8 156
Romania 2109 65 209
Poland 2055 31 7
Luxembourg 1988 22 40
Ecuador 1962 60 3
Japan 1866 54 424
Russia 1836 9 66
Pakistan 1717 21 76
Philippines 1546 78 42
Thailand 1524 9 229
Saudi Arabia 1453 8 115
Indonesia 1414 122 75
Finland 1352 13 10
South Africa 1326 3 31
India 1251 32 102
Greece 1212 43 52
Iceland 1086 2 157
Mexico 993 20 35
Panama 989 24 4
Peru 950 24 53
Dominican Republic 901 42 4
Singapore 879 3 228
Argentina 820 23 228
Colombia 798 12 15
Croatia 790 6 67
Serbia 785 16 0
Slovenia 756 11 10
Estonia 715 3 20
Qatar 693 1 51
Egypt 656 41 150
Iraq 630 46 152
United Arab Emirates 611 5 61
New Zealand 589 1 63
Algeria 584 35 37
Morocco 556 33 15
Ukraine 548 13 8
Bahrain 515 4 279
Lithuania 491 7 7
Armenia 482 3 30
Hungary 447 15 34
Lebanon 446 11 35
Latvia 376 0 1
Andorra 370 8 10
Bosnia-Herzegovina 368 10 17
Bulgaria 359 8 17
Slovakia 336 0 7
Costa Rica 330 2 4
Tunisia 312 8 3
Uruguay 310 1 0
Kazakhstan 302 1 21
Moldova 298 2 15
North Macedonia 285 7 12
Azerbaijan 273 4 26
Jordan 268 5 26
Kuwait 266 0 72
Burkina Faso 246 12 31
Cyprus 230 7 22
San Marino 230 25 13
Albania 223 11 44
Vietnam 203 0 55
Oman 179 0 29
Afghanistan 170 4 2
Cuba 170 4 4
Ivory Coast 168 1 6
Senegal 162 0 27
Malta 156 0 2
Belarus 152 0 32
Ghana 152 5 2
Uzbekistan 149 2 7
Cameroon 139 6 5
Honduras 139 7 3
Venezuela 135 3 39
Nigeria 131 2 8
Mauritius 128 3 0
Brunei 127 1 38
Sri Lanka 122 2 15
Cambodia 107 0 21
Georgia 103 0 20
Bolivia 97 4 0
Kosovo 94 1 1
Kyrgyzstan 94 0 3
Montenegro 91 1 0
Trinidad and Tobago 82 3 1
Rwanda 70 0 0
Paraguay 64 3 1
Liechtenstein 62 0 0
Kenya 50 1 1
Bangladesh 49 5 19
Monaco 49 1 1
Taiwan 45 1 15
Madagascar 43 0 0
Czech Republic 41 0 0
Guatemala 36 1 10
Jamaica 36 1 2
Zambia 35 0 0
Barbados 33 0 0
Uganda 33 0 0
El Salvador 30 0 0
Togo 30 1 1
Niger 27 3 0
Mali 25 2 0
Ethiopia 23 0 4
Guinea 22 0 0
Palestine 22 0 0
Tanzania 19 0 1
Djibouti 18 0 0
Maldives 17 0 13
Haiti 15 0 1
Bahamas 14 0 1
Equatorial Guinea 12 0 0
Eritrea 12 0 0
Mongolia 12 0 2
Dominica 11 0 0
Namibia 11 0 2
Syria 10 2 0
Grenada 9 0 0
Saint Lucia 9 0 1
Guinea-Bissau 8 0 0
Guyana 8 1 0
Laos 8 0 0
Libya 8 0 0
Mozambique 8 0 0
Seychelles 8 0 0
Suriname 8 0 0
Angola 7 2 0
Antigua and Barbuda 7 0 0
Gabon 7 1 0
Saint Kitts and Nevis 7 0 0
Zimbabwe 7 1 0
Benin 6 0 0
Cape Verde 6 1 0
Holy See 6 0 0
Sudan 6 2 0
Chad 5 0 0
Fiji 5 0 0
Mauritania 5 1 2
Nepal 5 0 1
Bhutan 4 0 0
Gambia 4 1 0
Nicaragua 4 1 0
Belize 3 0 0
Botswana 3 0 0
Central African Republic 3 0 0
Liberia 3 0 0
Somalia 3 0 0
East Timor 1 0 0
Papua New Guinea 1 0 0
Saint Vincent and the Grenadines 1 0 1
Republic of the Congo 0 0 0

Alguns gráficos exploratórios com a base do JHU

Evolução dos casos após o 30º caso confirmado
DateRep Japan USA Italy France Germany Spain Brazil Argentina Chile
2020-02-06 45
2020-02-15 43
2020-02-16 59
2020-02-17 66
2020-02-18 74
2020-02-19 84
2020-02-20 94
2020-02-21 105 35
2020-02-22 122 35 62
2020-02-23 147 35 155
2020-02-24 159 53 229
2020-02-25 170 53 322
2020-02-26 189 59 453
2020-02-27 214 60 655 38 46
2020-02-28 228 62 888 57 48 32
2020-02-29 241 70 1128 100 79 45
2020-03-01 256 76 1694 130 130 84
2020-03-02 274 101 2036 191 159 120
2020-03-03 293 122 2502 204 196 165
2020-03-04 331 153 3089 285 262 222
2020-03-05 360 221 3858 377 482 259
2020-03-06 420 278 4636 653 670 400
2020-03-07 461 417 5883 949 799 500
2020-03-08 502 537 7375 1126 1040 673
2020-03-09 511 605 9172 1209 1176 1073
2020-03-10 581 959 10149 1784 1457 1695 31
2020-03-11 639 1281 12462 2284 1908 2277 38
2020-03-12 639 1663 12462 2284 2078 2277 52
2020-03-13 701 2179 17660 3667 3675 5232 151 31 43
2020-03-14 773 2726 21157 4480 4585 6391 151 34 61
2020-03-15 839 3499 24747 4513 5795 7798 162 45 74
2020-03-16 825 4632 27980 6650 7272 9942 200 56 155
2020-03-17 878 6421 31506 7683 9257 11748 321 68 201
2020-03-18 889 7786 35713 9052 12327 13910 372 79 238
2020-03-19 924 13680 41035 10886 15320 17963 621 97 238
2020-03-20 963 19101 47021 12632 19848 20410 793 128 434
2020-03-21 1007 25493 53578 14308 22213 25374 1021 158 537
2020-03-22 1086 33746 59138 16214 24873 28603 1546 266 632
2020-03-23 1128 43667 63927 20123 29056 35136 1924 266 746
2020-03-24 1193 53740 69176 22622 32986 39885 2247 387 922
2020-03-25 1307 65778 74386 25600 37323 49515 2554 387 1142
2020-03-26 1387 83836 80589 29551 43938 57786 2985 502 1306
2020-03-27 1468 101657 86498 33402 50871 65719 3417 589 1610
2020-03-28 1693 121478 92472 38105 57695 73235 3904 690 1909
2020-03-29 1866 140886 97689 40708 62095 80110 4256 745 2139
2020-03-30 1866 161807 101739 45170 66885 87956 4579 820 2449

Calculando a taxa de progressão dia-a-dia: Brasil, Itália, USA, França, Alemanha, Espanha

DateRep Brazil France Germany Italy Japan China Spain USA
2020-03-01 1.00 1.30 1.65 1.50 1.062 1.01 1.87 1.09
2020-03-02 1.00 1.47 1.22 1.20 1.070 1.00 1.43 1.33
2020-03-03 1.00 1.07 1.23 1.23 1.069 1.00 1.38 1.21
2020-03-04 2.00 1.40 1.34 1.23 1.130 1.00 1.35 1.25
2020-03-05 1.00 1.32 1.84 1.25 1.088 1.00 1.17 1.44
2020-03-06 3.25 1.73 1.39 1.20 1.167 1.00 1.54 1.26
2020-03-07 1.00 1.45 1.19 1.27 1.098 1.00 1.25 1.50
2020-03-08 1.54 1.19 1.30 1.25 1.089 1.00 1.35 1.29
2020-03-09 1.25 1.07 1.13 1.24 1.018 1.00 1.59 1.13
2020-03-10 1.24 1.48 1.24 1.11 1.137 1.00 1.58 1.59
2020-03-11 1.23 1.28 1.31 1.23 1.100 c(“1.00”, “1.00”) 1.34 1.34
2020-03-12 1.37 1.00 1.09 1.00 1.000 c(“1.00”, “1.00”) 1.00 1.30
2020-03-13 2.90 1.61 1.77 1.42 1.097 1.00 2.30 1.31
2020-03-14 1.00 1.22 1.25 1.20 1.103 1.00 1.22 1.25
2020-03-15 1.07 1.01 1.26 1.17 1.085 1.00 1.22 1.28
2020-03-16 1.23 1.47 1.25 1.13 0.983 1.00 1.27 1.32
2020-03-17 1.60 1.16 1.27 1.13 1.064 1.00 1.18 1.39
2020-03-18 1.16 1.18 1.33 1.13 1.013 1.00 1.18 1.21
2020-03-19 1.67 1.20 1.24 1.15 1.039 1.00 1.29 1.76
2020-03-20 1.28 1.16 1.30 1.15 1.042 1.00 1.14 1.40
2020-03-21 1.29 1.13 1.12 1.14 1.046 1.00 1.24 1.33
2020-03-22 1.51 1.13 1.12 1.10 1.078 1.00 1.13 1.32
2020-03-23 1.24 1.24 1.17 1.08 1.039 1.00 1.23 1.29
2020-03-24 1.17 1.12 1.14 1.08 1.058 1.00 1.14 1.23
2020-03-25 1.14 1.13 1.13 1.08 1.096 1.00 1.24 1.22
2020-03-26 1.17 1.15 1.18 1.08 1.061 1.00 1.17 1.27
2020-03-27 1.14 1.13 1.16 1.07 1.058 1.00 1.14 1.21
2020-03-28 1.14 1.14 1.13 1.07 1.153 1.00 1.11 1.19
2020-03-29 1.09 1.07 1.08 1.06 1.102 1.00 1.09 1.16
2020-03-30 1.08 1.11 1.08 1.04 1.000 1.00 1.10 1.15

Países com números de casos semelhantes ao Brasil: 30-03-2020

Olhando os dados de: - Portugal - Suécia (Sweden) - Turquia (Turkey) - Israel - Austrália (Australia)

Evolução dos casos após o 30º caso confirmado
DateRep Australia Sweden Israel Portugal Brazil Turkey
2020-03-02 30
2020-03-03 39
2020-03-04 52 35
2020-03-05 55 94
2020-03-06 60 101
2020-03-07 63 161
2020-03-08 76 203 39 30
2020-03-09 91 248 39 30
2020-03-10 107 355 58 41 31
2020-03-11 128 500 109 59 38
2020-03-12 128 599 131 59 52
2020-03-13 200 814 161 112 151
2020-03-14 250 961 193 169 151
2020-03-15 297 1022 251 245 162
2020-03-16 377 1103 255 331 200
2020-03-17 452 1190 337 448 321 47
2020-03-18 568 1279 433 448 372 98
2020-03-19 681 1439 677 785 621 192
2020-03-20 791 1639 705 1020 793 359
2020-03-21 1071 1763 883 1280 1021 670
2020-03-22 1490 1931 1071 1600 1546 1236
2020-03-23 1682 2046 1442 2060 1924 1529
2020-03-24 2044 2286 1930 2362 2247 1872
2020-03-25 2364 2526 2369 2995 2554 2433
2020-03-26 2810 2840 2693 3544 2985 3629
2020-03-27 3143 3069 3035 4268 3417 5698
2020-03-28 3640 3447 3619 5170 3904 7402
2020-03-29 3984 3700 4247 5962 4256 9217
2020-03-30 4361 4028 4695 6408 4579 10827

Calculando a taxa de progressão dia-a-dia: Brazil, Portugal, Sweden, Turkey, Israel, Australia

DateRep Australia Brazil Israel Sweden Portugal Turkey
2020-03-01 1.08 1.00 1.43 1.17
2020-03-02 1.11 1.00 1.00 1.07 NA
2020-03-03 1.30 1.00 1.20 1.40 1.00
2020-03-04 1.33 2.00 1.25 1.67 2.50
2020-03-05 1.06 1.00 1.07 2.69 1.60
2020-03-06 1.09 3.25 1.31 1.07 1.62
2020-03-07 1.05 1.00 1.00 1.59 1.54
2020-03-08 1.21 1.54 1.86 1.26 1.50
2020-03-09 1.20 1.25 1.00 1.22 1.00
2020-03-10 1.18 1.24 1.49 1.43 1.37
2020-03-11 1.20 1.23 1.88 1.41 1.44 NA
2020-03-12 1.00 1.37 1.20 1.20 1.00 1.00
2020-03-13 1.56 2.90 1.23 1.36 1.90 5.00
2020-03-14 1.25 1.00 1.20 1.18 1.51 1.00
2020-03-15 1.19 1.07 1.30 1.06 1.45 1.20
2020-03-16 1.27 1.23 1.02 1.08 1.35 3.00
2020-03-17 1.20 1.60 1.32 1.08 1.35 2.61
2020-03-18 1.26 1.16 1.28 1.07 1.00 2.09
2020-03-19 1.20 1.67 1.56 1.13 1.75 1.96
2020-03-20 1.16 1.28 1.04 1.14 1.30 1.87
2020-03-21 1.35 1.29 1.25 1.08 1.25 1.87
2020-03-22 1.39 1.51 1.21 1.10 1.25 1.84
2020-03-23 1.13 1.24 1.35 1.06 1.29 1.24
2020-03-24 1.22 1.17 1.34 1.12 1.15 1.22
2020-03-25 1.16 1.14 1.23 1.10 1.27 1.30
2020-03-26 1.19 1.17 1.14 1.12 1.18 1.49
2020-03-27 1.12 1.14 1.13 1.08 1.20 1.57
2020-03-28 1.16 1.14 1.19 1.12 1.21 1.30
2020-03-29 1.09 1.09 1.17 1.07 1.15 1.25
2020-03-30 1.09 1.08 1.11 1.09 1.07 1.17

Base de dados do Worldometer

Esta base de dados tem uma atualização bem interessante, com algumas variáveis também interessantes.

Ela está disponível em https://www.worldometers.info/coronavirus/

O problema é que não achei nenhum csv ou xlsx para baixar; então vou tentar fazer um web scraping e pegar os dados. Utilizando o pacote rvest e seguindo a dica deste post foi razoavelmente fácil.

Olhando a estrutura destes dados:

## 'data.frame':    205 obs. of  11 variables:
##  $ Country,Other   : chr  "USA" "Italy" "Spain" "Germany" ...
##  $ TotalCases      : chr  "181,906" "105,792" "94,417" "70,985" ...
##  $ NewCases        : chr  "+18,118" "+4,053" "+6,461" "+4,100" ...
##  $ TotalDeaths     : chr  "3,655" "12,428" "8,269" "682" ...
##  $ NewDeaths       : chr  "+514" "+837" "+553" "+37" ...
##  $ TotalRecovered  : chr  "6,262" "15,729" "19,259" "15,824" ...
##  $ ActiveCases     : chr  "171,989" "77,635" "66,889" "54,479" ...
##  $ Serious,Critical: chr  "3,981" "4,023" "5,607" "1,979" ...
##  $ Tot Cases/1M pop: chr  "550" "1,750" "2,019" "847" ...
##  $ Deaths/1M pop   : num  11 206 177 8 54 35 26 50 3 61 ...
##  $ Reported1st case: chr  "Jan 20" "Jan 29" "Jan 30" "Jan 26" ...

Depois de pegar a tabela em html e colocar em um data.frame, algumas limpezas e transformações são necessárias: algumas colunas, como a NewCases, tem o símbolo +; os números vieram formatados como strings com separador de milhar (,), e algumas outras coisas. Então, algumas manipulações serão feitas para acertar isso.

Country,Other TotalCases NewCases TotalDeaths NewDeaths TotalRecovered ActiveCases Serious,Critical Tot Cases/1M pop Deaths/1M pop Reported1st case
USA 181,906 +18,118 3,655 +514 6,262 171,989 3,981 550 11 Jan 20
Italy 105,792 +4,053 12,428 +837 15,729 77,635 4,023 1,750 206 Jan 29
Spain 94,417 +6,461 8,269 +553 19,259 66,889 5,607 2,019 177 Jan 30
Germany 70,985 +4,100 682 +37 15,824 54,479 1,979 847 8 Jan 26
France 52,128 +7,578 3,523 +499 9,444 39,161 5,565 799 54 Jan 23
Iran 44,605 +3,110 2,898 +141 14,656 27,051 3,703 531 35 Feb 18

Total de Casos pelos dados do Worldometer: 31-03-2020

TotalCasos TotalMortes TotalRecuperados
848329 41593 176545

Lista de países ordenados por número de casos confirmados: 31-03-2020

Country TotalCases TotalDeaths TotalRecovered
USA 181906 3655 6262
Italy 105792 12428 15729
Spain 94417 8269 19259
China 81518 3305 76052
Germany 70985 682 15824
France 52128 3523 9444
Iran 44605 2898 14656
UK 25150 1789 135
Switzerland 16605 433 1823
Turkey 13531 214 243
Belgium 12775 705 1696
Netherlands 12595 1039 250
Austria 10122 128 1095
S. Korea 9786 162 5408
Canada 8505 95 1162
Portugal 7443 160 43
Brazil 5717 201 127
Israel 5358 20 224
Norway 4635 39 13
Australia 4561 19 337
Sweden 4435 180 16
Czechia 3257 31 45
Ireland 3235 71 5
Denmark 2860 90 1
Malaysia 2766 43 537
Chile 2738 12 156
Russia 2337 17 121
Poland 2311 33 7
Romania 2245 82 220
Ecuador 2240 75 54
Luxembourg 2178 23 80
Philippines 2084 88 49
Japan 1953 56 424
Pakistan 1938 26 76
Thailand 1651 10 342
Saudi Arabia 1563 10 165
Indonesia 1528 136 81
Finland 1418 17 10
India 1397 35 123
South Africa 1353 5 31
Greece 1314 49 52
Iceland 1135 2 198
Dominican Republic 1109 51 5
Mexico 1094 28 35
Panama 1075 27 9
Peru 1065 30 394
Argentina 966 26 240
Singapore 926 3 240
Colombia 906 16 31
Serbia 900 23 42
Croatia 867 6 67
Slovenia 802 15 10
Qatar 781 2 62
Estonia 745 4 26
Algeria 716 44 46
Hong Kong 714 4 128
Diamond Princess 712 10 603
Egypt 710 46 157
Iraq 694 50 170
UAE 664 6 61
New Zealand 647 1 74
Ukraine 645 17 10
Morocco 602 36 24
Bahrain 567 4 295
Lithuania 537 8 7
Armenia 532 3 30
Hungary 492 16 37
Lebanon 463 12 37
Bosnia and Herzegovina 418 12 17
Bulgaria 399 8 17
Latvia 398 1
Andorra 376 12 10
Slovakia 363 3
Tunisia 362 10 3
Moldova 353 4 18
Costa Rica 347 2 4
Kazakhstan 343 2 24
North Macedonia 329 9 12
Taiwan 322 5 39
Uruguay 320 1 25
Azerbaijan 298 5 26
Kuwait 289 73
Jordan 274 5 30
Cyprus 262 8 23
Burkina Faso 261 14 32
Réunion 247 1
Albania 243 15 52
San Marino 230 25 13
Vietnam 207 58
Cameroon 193 6 5
Oman 192 34
Cuba 186 6 8
Senegal 175 40
Afghanistan 174 4 5
Uzbekistan 172 2 7
Faeroe Islands 169 74
Malta 169 2
Ivory Coast 168 1 6
Ghana 161 5 31
Belarus 152 1 47
Mauritius 143 5
Sri Lanka 143 2 17
Honduras 141 7 3
Channel Islands 141 3
Venezuela 135 3 39
Nigeria 135 2 8
Brunei 129 1 45
Martinique 128 3 27
Palestine 117 1 18
Guadeloupe 114 4 22
Georgia 110 21
Montenegro 109 2
Cambodia 109 23
Bolivia 107 6
Kyrgyzstan 107 3
DRC 98 8 2
Mayotte 94 1 10
Trinidad and Tobago 85 3 1
Rwanda 75
Gibraltar 69 34
Liechtenstein 68
Paraguay 65 3 1
Isle of Man 60
Kenya 59 1 1
Madagascar 57
Aruba 55 1
Monaco 52 1 2
Bangladesh 51 5 25
Uganda 44
French Guiana 43 6
Macao 41 10
Guatemala 38 1 10
Jamaica 36 1 2
French Polynesia 36
Zambia 35
Togo 34 1 10
Barbados 34
El Salvador 32
Djibouti 30
Mali 28 2
Niger 27 3
Bermuda 27 10
Ethiopia 26 2
Guinea 22
Tanzania 19 1 1
Congo 19
Maldives 18 13
Gabon 16 1
New Caledonia 16
Myanmar 15 1
Saint Martin 15 1 2
Eritrea 15
Haiti 15 1
Bahamas 14 1
Guyana 12 2
Cayman Islands 12 1
Dominica 12
Equatorial Guinea 12 1
Mongolia 12 2
Curaçao 11 1 2
Namibia 11 2
Syria 10 2
Greenland 10 2
Seychelles 10
Benin 9 1
Grenada 9
Laos 9
Saint Lucia 9 1
Eswatini 9
Zimbabwe 8 1
Guinea-Bissau 8
Libya 8
Mozambique 8
Saint Kitts and Nevis 8
Suriname 8
Angola 7 2 1
Sudan 7 2 1
Antigua and Barbuda 7
Chad 7
Cabo Verde 6 1
Mauritania 6 1 2
Vatican City 6
St. Barth 6 1
Sint Maarten 6
Nepal 5 1
Fiji 5
Montserrat 5
Somalia 5 1
Turks and Caicos 5
Gambia 4 1
Nicaragua 4 1
Bhutan 4
Belize 3
Botswana 3
British Virgin Islands 3
CAR 3
Liberia 3
MS Zaandam 2
Anguilla 2
Burundi 2
Papua New Guinea 1
St. Vincent Grenadines 1 1
Sierra Leone 1
Timor-Leste 1

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